El Ministerio del Interior de Eslovaquia recomienda que la dirección de las instituciones estatales en situaciones de emergencia se sometan a una revisión íntegra, ya que ha quedado demostrado que éstas no se encontraban preparadas ni para la primera, ni para la segunda ola de la pandemia.
Los analistas de la Oficina Nacional de Control en octubre señalaron que el material sanitario se adquirió a precios elevados y que las instituciones estatales no estaban preparadas para la pandemia. La Administración de Reservas Materiales del Estado no tenía datos claros para realizar el pedido del material sanitario. Por esta razón no fue capaz de asegurar el material imprescindible para los hospitales, las residencias de ancianos ni para el personal que se encontraba en primera línea. El mayor problema según el presidente de la mencionada oficina, Ľubomír Andrassy, se debió a que de forma activa la Comisión de Crisis tomó parte en las decisiones del Ejecutivo, aunque sus funciones no estaban claramente definidas.